Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
USP35Q9P2H5 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms