Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms