Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms