Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL929601.3-201ENST00000613990 2086 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 POLR3B-202ENST00000539066 4118 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 THAP12P6-201ENST00000431978 2310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 C2orf49-201ENST00000258457 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SLFN11-201ENST00000308377 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ANO2-202ENST00000356134 3717 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MGC15885-201ENST00000558940 2425 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZMAT3-201ENST00000311417 9406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PPFIA2-214ENST00000549325 4727 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 UVSSA-201ENST00000324803 4441 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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