Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AL157714.1-201ENST00000448964 625 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RN7SL749P-201ENST00000460421 290 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC087354.1-201ENST00000522373 1037 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC117372.1-201ENST00000548633 620 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC002375.1-201ENST00000551161 581 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC005329.2-202ENST00000589673 392 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SCGB2B3P-201ENST00000599388 409 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC011483.4-201ENST00000623621 585 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 FAM240B-202ENST00000637691 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TRIO-225ENST00000639876 769 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 C7orf71-201ENST00000409974 1956 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CCDC39-201ENST00000442201 3279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TRHR-202ENST00000518632 1660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 HEATR9-204ENST00000603870 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 IL26-201ENST00000229134 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RNA5SP69-201ENST00000364477 117 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RABL2A-201ENST00000376439 623 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MIR623-201ENST00000384986 98 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LDHAP4-201ENST00000397561 998 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC006195.1-201ENST00000423599 923 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP000532.1-201ENST00000440999 177 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL078599.2-201ENST00000457116 471 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 HNRNPCP10-201ENST00000457130 884 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RN7SL420P-201ENST00000463843 298 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CACNA1C-AS2-201ENST00000545526 609 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC109630.1-201ENST00000558846 730 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SHBG-209ENST00000572182 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 FAM95B1-210ENST00000591605 743 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC005614.2-201ENST00000595508 461 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC092723.1-201ENST00000599411 474 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SAXO1-203ENST00000542071 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms