Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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TCOF1Q13428 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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TCOF1Q13428 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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TCOF1Q13428 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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TCOF1Q13428 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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TCOF1Q13428 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
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TCOF1Q13428 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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TCOF1Q13428 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TCOF1Q13428 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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