Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC5Q9UQL6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms