Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP35Q9P2H5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms