Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX2Q99697 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms