Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD5Q99666 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD5Q99666 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms