Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP3Q96P20 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP3Q96P20 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms