Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCHS1Q96JQ0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms