Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EAF1Q96JC9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms