Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SncbQ91ZZ3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms