Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC4DQ8WXI8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4DQ8WXI8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms