Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim68Q8K243 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim68Q8K243 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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