Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JMJD6Q6NYC1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms