Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR78Q5VTH9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR78Q5VTH9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms