Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAVIN4Q5BKX8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN4Q5BKX8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms