Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN2BQ14CS0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms