Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC10A1Q14973 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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