Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD2Q13563 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKD2Q13563 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKD2Q13563 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
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