Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms