Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCB1Q12824 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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