Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABPAQ06546 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms