Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNEQ04844 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNEQ04844 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms