Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GBE1Q04446 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GBE1Q04446 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms