Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTUD4Q01804 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms