Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms