Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms