Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTTP42858 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTTP42858 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTTP42858 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTTP42858 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTTP42858 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTTP42858 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTTP42858 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTTP42858 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTTP42858 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTTP42858 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTTP42858 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTTP42858 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms