Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eftud2O08810 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms