Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms