Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 BX664727.3-202ENST00000421686 1761 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 IL15-207ENST00000514653 1388 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL590714.1-201ENST00000420498 379 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GAPDHP46-201ENST00000424043 994 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC025262.1-201ENST00000434563 589 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP001124.1-201ENST00000529628 385 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC016394.1-201ENST00000608444 833 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC006449.1-201ENST00000616263 571 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR13D1-202ENST00000641530 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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