Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms