Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 VN1R35P-201ENST00000428102 693 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EEF1A1P27-201ENST00000429983 1135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TULP3P1-201ENST00000442322 816 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC002463.1-201ENST00000453459 1188 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL592043.2-201ENST00000454146 743 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC117382.1-201ENST00000468074 730 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPL5P17-201ENST00000469685 877 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPSAP52-201ENST00000489520 1144 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR7E129P-201ENST00000504655 968 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GSTO3P-201ENST00000504733 718 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GAPDHP44-201ENST00000513513 1007 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC024022.1-203ENST00000515392 478 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC002428.1-201ENST00000523722 771 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP001767.2-201ENST00000527291 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP000911.4-201ENST00000532272 516 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 IGHV1OR15-4-201ENST00000560037 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MIR4682-201ENST00000580643 80 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RN7SL49P-201ENST00000581392 298 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC100843.2-201ENST00000589084 324 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP003121.1-201ENST00000609845 414 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC134981.1-201ENST00000628076 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZBTB20-AS5-203ENST00000628886 819 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC108477.1-201ENST00000636764 526 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CASP4-201ENST00000393150 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CSAG4-201ENST00000361201 755 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms