Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL731556.2-201ENST00000615610 770 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCS1P62166 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 MEST-203ENST00000378576 2180 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 IL36G-202ENST00000376489 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL590648.1-201ENST00000456479 460 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 RPL10P19-203ENST00000522289 663 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC022239.1-201ENST00000527922 435 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC009309.1-201ENST00000610262 460 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC244153.1-201ENST00000617990 702 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC005790.1-201ENST00000619774 450 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NCS1P62166 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 TSACC-202ENST00000368252 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCS1P62166 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms