Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ACADSBP45954 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms