Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 ODF2L-213ENST00000478286 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 USP17L21-202ENST00000621388 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 SOCS5P2-201ENST00000449637 1359 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 SLMAP-220ENST00000495364 1383 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC008537.3-201ENST00000623128 1881 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 OR10G7-201ENST00000330487 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 GNRHR2-202ENST00000361928 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 WISP3-205ENST00000409166 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 RPS5P2-201ENST00000415238 640 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AL355490.2-201ENST00000422848 548 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AL109659.1-201ENST00000431986 651 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 OSBPL10-AS1-204ENST00000436598 513 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 LINC00379-202ENST00000438789 464 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC130689.1-201ENST00000451056 408 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 RN7SL761P-201ENST00000463259 278 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC022973.1-201ENST00000490340 575 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC027343.3-201ENST00000504494 564 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 ATM-209ENST00000526567 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AP005135.1-201ENST00000532071 714 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 LINC02403-201ENST00000548215 484 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 NDUFA3P6-201ENST00000571486 250 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC090912.1-201ENST00000578831 570 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 GAPLINC-203ENST00000581029 613 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 FAM95B1-204ENST00000586273 798 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 FAM95B1-207ENST00000589112 768 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 LINC01320-209ENST00000625995 928 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC124017.1-202ENST00000506950 1616 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 USP15-202ENST00000312635 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 EEF1A1P7-201ENST00000596811 1394 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 KLRC1-203ENST00000408006 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 KIAA1328-203ENST00000586501 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NBR1Q14596 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 GLT8D1-202ENST00000394783 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RNU1-120P-201ENST00000363009 157 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 EGFLAM-205ENST00000397210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL512430.3-201ENST00000405355 441 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms