Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC087499.3-202ENST00000441215 1173 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms