Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 THADA-205ENST00000404790 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ARR3-202ENST00000374495 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 DYNLT3-202ENST00000378581 920 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP181-201ENST00000411188 316 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP53-201ENST00000433498 862 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC239367.1-201ENST00000439389 936 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FAR2P3-205ENST00000447059 604 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC006153.1-201ENST00000480135 371 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL449212.1-201ENST00000499853 517 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SNCA-211ENST00000508895 905 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC02295-201ENST00000557072 374 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SNCA-212ENST00000611107 297 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC01176-202ENST00000628121 716 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CADPS-220ENST00000613879 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FBXO36-201ENST00000283946 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 DTNA-233ENST00000601125 1931 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TCL6-207ENST00000483087 2194 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR10G4-201ENST00000320891 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FCAR-202ENST00000353758 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AIF1-203ENST00000376059 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP000317.1-201ENST00000427022 805 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC009228.1-203ENST00000430105 432 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL513318.1-201ENST00000437925 991 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIR4435-2HG-208ENST00000439494 707 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL772284.1-201ENST00000443421 905 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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