Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC135068.4-201ENST00000622949 925 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD12P35452 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD12P35452 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD12P35452 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD12P35452 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD12P35452 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD12P35452 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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