Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117338.1-201ENST00000434552 631 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355076.1-201ENST00000484315 270 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP82-208ENST00000496652 1112 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006499.1-201ENST00000511870 850 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC053513.1-201ENST00000543604 738 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023905.1-203ENST00000560180 765 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL321P-201ENST00000581742 299 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL15P-201ENST00000582825 301 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106037.1-201ENST00000584148 336 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078802.1-201ENST00000602879 843 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103691.1-201ENST00000619654 520 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP4-AS1-206ENST00000628174 919 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133406.1-201ENST00000404904 747 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP152-201ENST00000410444 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP1-AS1-212ENST00000418308 863 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01425-202ENST00000430060 760 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01852-201ENST00000434223 967 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092610.1-201ENST00000454916 373 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL520P-201ENST00000474110 286 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL65P-201ENST00000485221 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00499-203ENST00000510736 587 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRB4-203ENST00000535904 796 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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