Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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