Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

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Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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UBE3AQ05086 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBE3AQ05086 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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