Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.3-201ENST00000366116 282 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTM1-203ENST00000369819 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB11-203ENST00000371377 760 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008770.1-201ENST00000406892 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL18AP2-201ENST00000450007 482 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSK1A-201ENST00000450724 768 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00945-201ENST00000453716 753 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P17-201ENST00000469685 877 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL209P-201ENST00000488309 276 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIAP11-201ENST00000510729 493 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPT1P5-201ENST00000511433 521 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83A-AS1-201ENST00000517519 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136424.1-201ENST00000518425 542 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000911.4-201ENST00000532272 516 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL138P-201ENST00000577405 287 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSX3-204ENST00000612497 1030 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF1P9-202ENST00000629550 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRR3-202ENST00000472788 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABRAXAS1-208ENST00000515303 1732 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOSPD1-202ENST00000370779 773 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDGF1P4-201ENST00000401555 520 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCG5-202ENST00000413748 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO36-IT1-201ENST00000432957 582 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00545-201ENST00000440633 411 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092447.7-202ENST00000443198 580 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083939.1-201ENST00000445475 126 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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