Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS29Q9UBQ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS29Q9UBQ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms