Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPMQ9NSP4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms