Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gkap1Q9JMB0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms