Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EHD4Q9H223 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EHD4Q9H223 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms